1. "Esteban (Nr. 79)": Nachdem Liz aus ihrem Versteck auf Kuba von Alexander Kirk entführt wurde, der behauptet ihr Vater zu sein, unternimmt Reddington alles in seiner Macht stehende, um sie zu finden. Auch Tom und Agnes sind von Kirks Männern entführt worden, und Tom versucht sich aus ihren Händen zu befreien. Reddington lässt alle seine Beziehungen spielen, um über einen ehemaligen Mitarbeiter von Pinochet, Manuel Orentez Esteban, der mittlerweile alle möglichen lateinamerikanischen Staaten dabei berät und unterstützt die eigenen Bürger zu terrorisieren, den Aufenthaltsort von Liz in Erfahrung zu bringen.
2. "Mato (Nr. 66)": Kirk will Liz in den "Sommerpalast" bringen, ein Landhaus, in dem sie in ihrer Kindheit die Sommer verbracht haben. Er hofft, ihr dort beweisen zu können, dass sie tatsächlich seine Tochter, Masha, ist. Doch um zu entkommen, tötet Liz den Piloten des Wasserflugzeugs, das daraufhin über dem Golf von Mexiko abstürzt.
3. "Miles McGrath (Nr. 65)": Um Kirk zu überführen, jagt Reddingten zusammen mit Dembe den Unternehmer Miles McGrath, der sein Vermögen hauptsächlich in das organisierte Verbrechen investiert. Er soll für Kirk Erreger des Robowski Virus besorgen - mit denen Kirk seine Leukämie heilen möchte. Liz versucht ihre Tochter ausfindig zu machen - erhält jedoch keine Unterstützung durch das FBI. Sie verschafft sich Zugang zu Unterlagen über den Sommerpalast und stößt dabei auf Informationen über ihre Familie, die auch Reddington betreffen.
4. "Gaia (Nr. 81)": Auf der Suche nach Agnes gehen Liz’ und Toms Ansichten auseinander - und Tom geht eigene Wege, um Agnes zu retten. Reddington ist Kirk auf der Spur. Er jagt zusammen mit der Task Force den Öko-Terroristen Gaia, der eine Verbindung zu Kirk haben soll.
5. "Der Lindquist-Konzern (Nr. 105)": Ein Erfinder wird tot in seiner Garage gefunden und die Task Force beginnt ihre Jagd auf die Täter: Hinter dem Mord steckt die Gruppe "Der Lindquist-Konzern". Reddington nimmt Kirks Arzt in seine Gewalt und erfährt von ihm, dass sich Kirk bald in Genf aufhalten werde. Dort will ihm Red eine Fall stellen - gerät dabei jedoch selbst in Lebensgefahr. Derweil taucht ein DNA-Test auf, der Aufschluss darüber gibt, ob Kirk tatsächlich Liz’ Vater ist.
6. "Die Drosseln (Nr. 53)": Reddington will über den Geschäftsmann Le Bron an Kirk herankommen - denn Kirk ist einer von Le Brons Klienten. Liz und Reddington finden heraus, dass die Task Force von einer Hackergruppe überwacht wird: Drahtzieher hinter der Gruppe "Die Drosseln" ist Kirk. Dieser nimmt Kontakt zu Liz auf und sie vereinbaren ein Treffen. Sollte es Liz und Reddington gelingen, mit dieser Falle endlich Baby Agnes wiederzubekommen?
7. "Dr. Adrian Shaw (Nr. 98) - Teil 1": Als sich Kirks Gesundheitszustand im Gewahrsam des FBIs drastisch verschlechtert, muss Liz eine schwere Entscheidung treffen: Reddington führt die Task Force auf die Spur eines Fälschers, der neue Identitäten für flüchtige Kriminelle bereitstellt.
8. "Dr. Adrian Shaw (Nr. 98) - Teil 2": Reddington setzt Dr. Shaw unter Druck, um einen ehemaligen Patienten zu finden. Liz überdenkt ihre Beziehung zu Kirk noch einmal, der zunehmend bedrohlich handelt. Mr. Kaplan macht eine für ihre Zukunft wichtige Feststellung.
9. "Lipets Fischereierzeugnisse (Nr. 111)": Die Ermittlungen gegen einen internationalen Terroristen, der auf amerikanischem Boden operiert, stellt die Loyalität der Task Force auf die Probe, in der ein Maulwurf Reddington und Liz ausspioniert.
10. "Der Prognostiker (Nr. 163)": Liz findet vor ihrer Wohnungstür Dioramen, die grausame Verbrechen darstellen, bevor diese geschehen sind. Es stellt sich heraus, dass diese Schaubilder von einem Mädchen mit Entwicklungsstörungen namens Maggie erstellt werden. Deren Mutter ist überzeugt, dass ihre Tochter Vorahnungen hat, doch tatsächlich empfängt sie auf ihrem Hörgerät Telefonate aus dem Nachbargebäude. In diesen Gesprächen zwischen dem Unternehmer Farnsworth und seinem Komplizen Charnquist werden Morde geplant, die Einbrüche in Aktienkurse verursachen, um anschließend durch Leerverkäufe Gewinne an der Börse zu machen.
11. "Der Harem (Nr. 102)": Liz muss sich vor der Führerin einer Elite-Truppe von Diebinnen beweisen, um sich in ihre Organisation einschleusen zu können. Die Gruppe bestiehlt andere Diebe und bereitet gerade ihren nächsten Coup vor. Dabei geht es darum, die Zeugenschutzliste der Regierung zu stehlen, die wiederum ein anderer Verbrecher der Regierung gestohlen hat. Auf dieser Liste sind sämtliche Personen verzeichnet, denen von Staats wegen Zeugenschutz gewährt wird, und das macht sie in der Unterwelt sehr begehrt. Reddington möchte verhindern, dass diese Liste in die falschen Hände gerät, da sich darauf auch der Name von Mr. Kaplans Schwester befindet, die vor Jahren geholfen hat ein Mitglied der russischen Mafia hinter Gitter zu bringen. Gleichzeitig kämpft Reddington mit unerwarteten Problemen bei seinen Unternehmungen.
12. "Natalie Luca (Nr. 184)": Natalie trägt das Virus einer tödlich verlaufenden Krankheit in sich. Sie selber ist immun, sie dient jedoch als Wirt dieses Virus’. Eine Firma erkennt das Potential des Erregers als Biowaffe.
13. "Isabella Stone (Nr. 34)": Judith Pruitt, die sich auch Isabella Stone nennt, verbreitet auf einer Benefizveranstaltung des Arztes Justin Sperry Unwahrheiten über Reddington, der die Stifung anonym unterstützt. Tom begibt sich auf die Spuren seiner Vergangenheit.
14. "Der Architekt (Nr. 107)": Aram geht undercover, um den "Architekt" zu finden, ein kriminelles Mastermind. Obwohl es ihm widerstrebt, einen Außeneinsatz zu übernehmen, ist er der einzige, der für diese Aufgabe qualifiziert ist.
15. "Der Apotheker (Nr. 59)": Reddington wird vergiftet, als er gerade versucht, den Verräter in seinem Umfeld aufzudecken. Von nun an beginnt ein Spiel auf Zeit, bei dem Reddington herausfinden muss, wer ihn vergiftet hat, während er sich gleichzeitig der auftretenden Symptome erwehren muss.
16. "Dembe Zuma (Nr. 10)": Dembe muss Reddington seine Unschuld beweisen und stellt deshalb eigene Ermittlungen an. Dabei bekommt er unerwartete Hilfe.
17. "Requiem": Erinnerungen aus der Vergangenheit bringen Reddington auf einen gefährlichen Kollisionskurs mit einem Feind, der entschlossen ist Reddingtons kriminelles Imperium zu zerstören.
18. "Philomena (Nr. 61)": Die Task Force jagt einen Kopfgeldjäger, der es auf Reddingtons Verbündete abgesehen hat. Ressler steht vor einem moralischen Dilemma, als er sich gemeinsam mit einem alten Kollegen einer neuen Aufgabe widmet.
19. "Dr. Bogdan Krilov (Nr. 29)": Reddington lässt durch die Task Force Erinnerungen manipulieren. Dadurch stellt Liz ihre eigenen Erinnerungen in Frage. Ressler kümmert sich um einen anderen Fall.
20. "Der Schuldeneintreiber (Nr. 46)": Liz wird zum Ziel eines Söldners, der als der Schuldeneintreiber bekannt ist. Reddington wendet sich deshalb an einen ungewöhnlichen Kontakt, um Hilfe einzuholen. Ressler stößt auf unerwartete Probleme, als er versucht, Agent Gales Ermittlungen weiterhin einen Schritt voraus zu sein.
21. "Mr. Kaplan (Nr. 4) - Teil 1": Reddington, dessen Organisation sich einer lähmenden Belagerung ausgesetzt sieht, verfolgt einen Dieb, dem von Mr. Kaplan eine mysteriöse Aufgabe zugewiesen wurde. Agent Gale greift bei der Untersuchung des Verhaltens seiner Task Force auf extreme Maßnahmen zurück.
22. "Mr. Kaplan (Nr. 4) - Teil 2": Reddington tüftelt einen riskanten Plan aus, um die Task Force zu retten. Gerade als die Zukunft der Task Force in akuter Gefahr schwebt, wird Liz mit den größten Fragen ihrer Vergangenheit konfrontiert.